Uma força desconhecida ataca o Mundo Real, colocando todos sobre um sono eterno. Agumon e os seus amigos são arrastados para uma situação onde os seus amigos humanos estão todos a dormir, até que aparece uma rapariga que os informa sobre o que realmente se passa e ajuda-os. Agumon vê-se obrigado a lutar contra Argomon, um Digimon que pretendia deixar todos os humanos a dormirem eternamente devido às consequências que as suas irresponsáveis ações estavam a causar ao Mundo Digital.

Após um encontro casual com um trio de ladrões, os Piratas do Chapéu de Palha acabam em conflito com Eldoraggo, um pirata obcecado por ouro e com poderes de uma temível Akuma no Mi. O objetivo final de Eldoraggo: uma ilha lendária onde o Capitão Woonan teria supostamente guardado ouro além da imaginação. Com a ajuda de um velho vendedor e seu neto - possivelmente as únicas pessoas vivas relacionadas ao Woonan - os Chapéus de Palha devem superar Eldoraggo e sua tripulação, e descobrir por conta própria o segredo de seu maior tesouro. Considerando que Sanji ainda não havia se juntado à tripulação, o filme se passa após o Episódio 18 (de fato, no final do filme, é possível ver que Sanji ainda está no Baratie).

Um dia, as Pretty Cures recebem um convite para uma festa em sua homenagem. Todos estão indo para o local da festa, a escola das fadas, mas aguardam uma sombra misteriosa. A sombra rouba objetos de transformação! O que é que eles podem fazer? Se as Curas não puderem ser convertidas, estarão em apuros! Se isso continuar, a escola, nosso mundo e tudo mais serão devorados por aquela sombra! As 32 Pretty Cures lutarão para proteger a todos!