Em um pântano distante vive Shrek, um ogre solitário que vê, sem mais nem menos, a sua vida ser invadida por uma série de personagens de contos de fada, como um grande e malvado lobo, três porcos que não têm casa, entre outros. Todos eles foram expulsos das suas casas pelo malvado Lorde Farquaad. Determinado a recuperar a tranquilidade de antes, Shrek resolve encontrar Farquaad e faz um acordo com ele: todos os poderão voltar às suas casas se ele e o seu amigo Burro resgatarem uma bela princesa, que é prisioneira de um dragão. Porém, quando Shrek e o Burro conseguem finalmente resgatar a princesa descobrem que os seus problemas estão apenas a começar.

Numa inesperada oportunidade de sair da colmeia, a vida de Barry é salva por Vanessa, uma florista de Nova Iorque. À medida que a sua relação floresce, os olhos de Barry abrem-se para o mundo dos humanos e ele rapidamente descobre que as pessoas têm uma papel decisivo no consumo de mel em larga escala. Armado com esta informação, Barry apercebe-se da sua verdadeira missão na vida e decide processar a raça humana por roubar o mel às abelhas. Como resultado, as comunidades de humanos e abelhas envolvem-se como nunca antes, cada uma apontando o dedo à outra. Barry é apanhado no meio e dá consigo com problemas bastante invulgares para resolver…