O tema deste filme é a violência juvenil, suas tristes raízes e terríveis consequências. A personagem principal é a professora Moriguchi, que está saindo da escola. Em seu último dia, confessa aos alunos de sua classe que sua filha de 4 anos, Manami, não morreu acidentalmente, como concluiu a investigação policial. Ela foi assassinada por alunos de sua classe, aos quais passa a chamar de "aluno A" e "aluno B". Apesar de não citar seus nomes, a descrição das características e feitos de cada um revela suas identidades. O motivo que os levou a isso, bem como o envolvimento de parentes e amigos, são narrados sob a forma de confissões de 6 pessoas, tais como peças de um puzzle.

Gran Tesoro, um país independente, casa do maior barco cidade do entretenimento do mundo, onde os Piratas, Fuzileiros Navais, e milionários de todo o mundo reúnem-se em um "santuário absoluto" que nem mesmo o Governo Mundial quer tocar. Lá, os piratas do chapéu de palha encontram o governante do país, o Imperador dourado, Gild Tesoro, que ganha facilmente aos piratas, os fuzileiros e até mesmo ao governo mundial. Ele está prestes a tomar medidas para satisfazer a sua ambição desmedida, o que pode resultar em grandes alterações na relação de poder no novo mundo...