A história gira em torno da vida do jovem Seita e sua irmã mais nova, Setsuko. Enquanto seu pai combate os americanos em alto-mar, Seita e Setsuko vivem com a mãe, sempre às voltas com os constantes alertas de ataques aéreos. Após perderem a mãe num intenso bombardeio, Seita e Setsuko são obrigados a amadurecer rapidamente e enfrentar situações difíceis e penosas... ainda assim, fazem de tudo para encontrar alegria e satisfação nas menores coisas, como um banho de mar ou observando vagalumes à noite. Mas a fome crescente, as doenças e a insensibilidade dos adultos tornam a vida de ambos cada vez mais dura, e as perspectivas para o futuro ficam cada vez mais sombrias...

Antes de ser um protetor, Kenshin era um temível assassino conhecido como Battosai. Contudo, quando conheceu a amável Tomoe Yukishiro, a sua história começou a mudar.

Em 2084 a humanidade aposta todas as fichas em uma mulher que deve salvar o mundo da invasão de uma raça alienígena. Para isso ele terá que voltar a 2002, quando tudo começou e onde conhece um misterioso mercenário. Juntos eles se infiltram em uma base do governo e descobrem o porquê da invasão.