Quando Shoutarou Tatewaki encontra Sakurako Kujou pela primeira vez, ele sabe que sua vida nunca mais será a mesma. Inicialmente acreditando que ela fosse responsável por um desaparecimento no bairro, ele mais tarde aprende sobre seu verdadeiro talento: analisando espécimes ósseos. Sakurako tem bastante a coleção de ossos de animais reconstruídos, mas ela deseja que ela tinha mais da variedade humana, muito para o desgosto daqueles ao seu redor. Logo, Shoutarou começa a acompanhar o excêntrico osteologista sobre os muitos casos não resolvidos diferentes que ela vem através-geralmente a forma de corpos em decomposição. Mas com tantos incidentes acontecendo em torno deles, poderia haver um mistério maior no trabalho em suas vidas? Sakurako-San no Ashimoto Ni wa Shitai GA Umatteiru é uma história de dois parceiros improváveis, cada um mostrando em sua própria maneira que os ossos podem dizer como um morreu, mas só as pessoas podem dizer como eles viviam.

Um jogador sem objetivos e os seus dois amigos dão por si numa versão paralela de Tóquio, onde são obrigados a competir em vários jogos sádicos para sobreviver.