Três anos após os sobreviventes do primeiro "Battle Royale" terem escapado da ilha, vamos encontrar Nanahara e Nakagawa, à frente de um grupo terrorista internacional anti-BR e antigoverno. Declarando guerra a todos os adultos que apoiaram a Lei BR o grupo lança um ataque devastador a Tóquio. Em nome da Justiça, o governo riposta criando a Lei Anti Terrorismo do Milénio ou BR-II, um "jogo" com regras novas e mais cruéis. Um ano mais tarde, uma turma de 42 alunos do 9º ano é sequestrada, obrigada a vestir fardas da tropa e a colocar coleiras eletrónicas mortais. O professor informa-os que foram escolhidos para o BR-II, um novo jogo de guerra contra o terrorismo. "Tem 72 horas para descobrir e matar Nanahara se quiserem ganhar e sobreviver." Um dos alunos recusa-se a participar e é morto ali mesmo. Sob as novas regras, a coleira de uma aluna é ativada, matando-a de imediato. Agora só faltam 40... Os restantes são enviados para as linhas da frente da "guerra contra o terror".

A Ira de Zoroark foi Libertada! A Pokémon Baccer World Cup. É o evento mais esperado do ano e, enquanto centenas de pessoas se dirigem à Cidade de Crown para assistir à empolgante competição, Ash, Pikachu e os seus amigos conhecem um novo e misterioso Pokémon. Mas quando os três Lendários Pokémon, Raikou, Entei e Suicune, de repente chegam e começam a atacar as ruas, está na altura de Ash e os seus companheiros, juntamente com o seu novo amigo Pokémon Zorua, tentarem descobrir o segredo por detrás das imensas e poderosas forças que estão em ação. Que estranhos e perigosos poderes se movem pela Cidade de Crown? Porque Celebi decidiu regressar após ter desaparecido durante 20 anos? E porque está o poderoso Zoroark a libertar a sua ira sobre a cidade? As respostas a estas questões levam a um caminho repleto de perigos – irão Ash e os seus companheiros arranjar coragem, força e amizade suficientes para descobrir o mistério a tempo de salvar a Cidade de Crown?