Gantz conta a história do adolescente de 15 anos, Kei Kurono, que morre atropelado por um trem junto de um amigo, Masaru Katou. Após isso, os dois são transportados para uma sala para participar de um jogo sanguinário, violento e competitivo, comandado por uma "esfera negra" chamada Gantz.

A história gira em torno de Kaname Chidore, uma das mais populares garotas da escola em que estuda, que vive uma vida normal de estudante do colegial até que um estranho jovem chamado Sousuke Sagara aparece em sua classe. Ela logo descobre que Sousuke faz parte de uma força de elite anti-terrorista e sua missão é protege-la de qualquer um que possa tentar sequestra-la. Como fica revelado mais adiante, Kaname é uma "Whispered", ela possui escondido nos mais profundos cantos de sua mente, o conhecimento de uma tecnologia avançada, muito além da conhecida pelo homem. Várias organizações terroristas estão tentando por suas mãos em Kaname para tomar posse deste conhecimento, a fim de utiliza-lo para construção de poderosas armas de destruição em massa, mais poderosas até que as Bombas Atómicas.

Com o programa espacial, os cientistas do século 21 começaram pesquisas para tornar Marte um planeta habitável aos humanos, assim enviaram baratas como parte das pesquisas de produção de energia em ambientes não propícios à vida. Agora, no ano de 2577, a primeira nave tripulada pousa em Marte e o que eles encontram não é a fonte de energia que os cientistas do passado estavam tentando criar com as baratas, mas sim terríveis mutantes humanoides que podem ameaçar a vida na Terra.

A história, a orgulhosa arcanja Lucifer desobedece Deus e é jogada para o nível mais inferior do inferno como um anjo caído. Em seu caminho para o inferno, Lucifer se encontra com uma colegial na Terra chamada Maria, que a ajuda. No inferno, Lucifer se encontra com Leviatã e Leviatã explica para Lucifer sobre os "Sete Pecados Capitais", os sete reis demônios que controlam o inferno. Após os "Sete Pecados Capitais" selarem os poderes de Lucifer, Lucifer parte em uma jornada com Maria e Leviatã para derrotá-los.