Em Karakura, uma repentina eclosão de espíritos chamados blanks (almas errantes) ocorreu, enquanto nos céus da Soul Society, o mundo real foi refletido. Uma misteriosa shinigami de nome Senna apareceu antes de Ichigo, juntamente com um homem chamado Ganryu, liderando um grupo nomeado os Dark Ones.

Alguém com uma foice ataca Mayuri, que estava em seu laboratório. Mayuri subitamente fica fora de controle e acaba acertando o painel de controle de seu laboratório. Com isso, toda a Seireitei fica coberta por uma nuvem de partículas espirituais, aprisionando todos os Shinigamis dentro de um casulo.

Compilação das histórias de "O Homem Que Ri" da primeira temporada de "Ghost in the Shell: Stand Alone Complex - Cidade Assombrada", sendo remodelado para uma renderização de melhor qualidade e embelezado com algumas novas sequências.

O ano é 2034. Passaram-se dois anos desde que Motoko Kusanagi deixou a Secção 9. Togusa é agora o novo líder da equipa, que aumentou consideravelmente o seu pessoal nomeado. A nova Secção 9 confronta uma onda de incidentes complicados, e as investigações revelam que um hacker ultra sofisticado está por detrás de toda a série de eventos.

Uma nova organização terrorista conhecida como "11 Individuais" está empenhada na destruição em massa. Será que a Major Kusanagi e a sua unidade anticrime de elite serão capazes de detê-los?

Tudo começa quando Hitsugaya e a sua equipa estavam transportando um tesouro real chamado Ouin, até ser atacado por um grupo misterioso. O tesouro é roubado e Hitsugaya que no momento estava enfrentando o líder do grupo, desaparece. Dias depois, Ichigo que já havia sido informado do desaparecimento, encontra com Hitsugaya ferido, e sem querer dizer nada, Ichigo acaba tendo que lutar com Hitsugaya. No meio da batalha, um hollow aparece dizendo que veio buscar Hitsugaya Toshirou e o leva embora.

Uma nova versão 3D de "Ghost in the Shell: Stand Alone Complex - Sociedade do Estado Sólido". O ano é 2034. Passaram-se dois anos desde que Motoko Kusanagi deixou a Secção 9. Togusa é agora o novo líder da equipa, que aumentou consideravelmente o seu pessoal nomeado. A nova Secção 9 confronta uma onda de incidentes complicados, e as investigações revelam que um hacker ultra sofisticado está por detrás de toda a série de eventos.

Em 2045, Motoko Kusanagi e a Secção 9 regressam para combater uma nova e perigosa ameaça neste filme que compila a primeira temporada de "Ghost in the Shell: SAC_2045".