No ano de 2022, finalmente é possível criar um mundo virtual dentro de um jogo graças à consola NerveGear e ao seu mais recente jogo, Sword Art Online, um MMORPG de realidade virtual. No entanto, passado algum tempo de entrarem no jogo, os jogadores de SAO descobrem que não conseguem sair do jogo. É então que o criador do jogo, Akihiko Kayaba, lhes diz que estão presos dentro do jogo e que, se morrerem lá, morrem também na vida real. A única maneira de todos os 10 mil jogadores presos dentro do jogo saírem de lá, é chegando ao 100º e último andar e derrotando o último boss.

Múltiplas gerações da família Joestar, todas com a mesma alcunha, defrontam vilões sobrenaturais ao longo de várias épocas.

Natsuo Fujii está apaixonado por sua professora, Hina. Tentando esquecer seus sentimentos em relação a ela, Natsuo vai para um mixer com seus colegas de classe, onde ele conhece uma garota estranha chamada Rui Tachibana. Em uma estranha reviravolta, Rui pede a Natsuo para sair com ela e fazer um favor a ela. Para sua surpresa, o destino deles é a casa de Rui - e o pedido dela é que ele faça sexo com ela. Não há amor por trás do ato; ela só quer aprender com a experiência. Pensando que isso poderia ajudá-lo a esquecer Hina, Natsuo concorda hesitante. Depois desse encontro incomum, Natsuo enfrenta agora um novo problema. Com seu pai se casando novamente, ele acaba com um novo par de irmãs; infelizmente, ele conhece bem essas duas garotas.