KAMUI é um dos Ninjas de um grupo vinculados por regras em busca da verdadeira liberdade. No entanto, ele está sobrecarregado com o destino, onde não é permitido levar o segredo dos seus poderes para fora da tribo – se você nasceu Ninja, deve morrer Ninja. Isto o leva a lutar constantemente por sua vida contra outros ninjas que tentam matá-lo e esconder os segredos. Ele não confia, e não ama. Mostrando fraqueza chegará à morte imediatamente. Um incidente o leva a uma antiga vila de pescadores, onde ele finalmente começa a sentir confiança e afeto para com os outros. No entanto, seus perseguidores, estão criando uma armadilha enorme para Kamui.

O duro comerciante francês Baldabiou (Molina) segura entre os seus dedos um véu tecido de fios de seda japoneses. É como se pegasse... em nada. Quando uma epidemia que devastou as criações de ovos em toda a Europa se espalhou por África e pela Índia, todo o comércio de seda na Europa ficou ameaçado. Para continuar o seu lucrativo negócio, Baldabiou decide enviar o jovem oficial do exército Herve Joncour (Pitt) numa perigosa missão ao Japão, separando-o durante vários meses de Helene (Knightley), a sua adorada e devota esposa. É aí que Herve conhece o poderoso e temido senhor local, Hara Jubei (Yakusho), com quem terá de negociar os preciosos ovos. E, num mundo diferente de qualquer um que Herve jamais conhecera, que fica seduzido pela concubina de Hara, uma misteriosa jovem de beleza embriagante. Sem perceberem uma palavra um do outro, os dois partilham um amor obsessivo e fatídico...